日前,江西农业大学青年教授李波博士与中国科学院昆明植物研究所向春雷博士联合组建的唇形科系统发育研究小组完成了唇形科系统发育基因组学研究。研究成果以“唇形科的族级新分类系统:基于叶绿体系统发育基因组学研究”(An updated tribal classification of Lamiaceae based on plastomephylogenomics)为题,于1月8日在《BMC 生物学》(BMCBiology)上发表(论文链接:https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-020-00931-z)。中国科学院昆明植物研究所赵飞、陈亚萍博士并列为文章第一作者,李波博士与向春雷博士为论文共同通讯作者,江西农业大学研究生闵道长同学参与了该项研究。
唇形科(Lamiaceae)为被子植物第六大科,全球有230余属7000余种,世界广布,中国是其多样性分布中心之一。该科植物具有重要的经济价值,在烹饪、药用、园艺、建材等方面有着广泛应用。2016—2017年,李波博士联合中、英、美等国家的唇形科分类专家提出了唇形科12个亚科的新分类系统(Li et al., 2016; Li andOlmstead,2017),引起了广泛关注,被子植物系统发育网站 (Angiosperm Phylogeny Website)据此对唇形科的分类系统进行了更新。然而,荆芥亚科Nepetoideae及筋骨草亚科Ajugoideae在该科中的确切系统位置及与其它亚科(如柚木亚科Tectonoideae、豆腐柴亚科Premnoideae等)间的亲缘关系仍未得到有效解决。在此背景下,李波博士与向春雷博士进一步联合中国、伊朗、美国、澳大利亚、挪威、奥地利、土耳其等国家的唇形科分类学家,对唇形科开展了全球范围的广泛取样。历经四年时间,获得了79个属的175个代表类群的叶绿体全基因组序列,并基于79个蛋白质编码基因重建了唇形科系统发育框架,验证了12个亚科的单系性,明确了荆芥亚科、筋骨草亚科与其近缘类群的系统发育关系,并进一步在族级水平上进行了分类系统更新,提出了唇形科12个亚科22个族的新分类系统。其中本研究建立了三个新族,并对各亚科和各族的分类历史、地理分布、形态特征、属种多样性等内容进行了全面阐述和系统总结。唇形科分类系统的构建将为后续科学高效开发唇形科植物资源提供理论依据。
稿源:江西农业大学
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