制药工程专业是适应现代医药行业需求而产生的一门交叉学科，是药学、化学、工程学、生物学和相关管理法规相互渗透而形成的工科类专业，主要培养从事药物制造与生产管理，新药物、新工艺、新设备的开发、放大和设计的高级工程技术人才。制药工程专业与药学、药物制剂的区别在于制药工程是一门工程技术科学，是在化学制药、中药制药、生物制药等领域中寻求共性知识和普遍规律，强化药品生产过程质量管理及工程化制药，主要解决药品生产制造过程中的工程技术问题和实施GMP管理，实现药品生产的规范化和规模化。
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