生物技术专业围绕创新型应用人才的培养目标，深入研究区域经济和社会发展对生物技术专业应用型人才的知识、能力和素质要求，以服务长三角地区特别是泰州地区经济社会发展为导向，以“强能力、重应用”为培养原则，以“顶天立地”即：研究型人才重理论与创新、应用型人才重应用于技能的分层培养为模式，培养具备生物技术基本理论与技能，能在生物医药、食品检验、发酵工业等行业的企事业单位从事与生物技术有关的应用研究、技术开发、营销管理、生产管理等工作的复合应用型人才。
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